Фудбалски клуб Лакташи је основан 1958. године као Лакташки спортски клуб (ЛСК). Оснивачка Скупштина клуба одржана је 20. августа 1958. године на иницијативу двојице фудбалских заљубљеника из Лакташа Милоша Вранчића и Бранка Бањца. Подршку овој идеји дало је тада и Југословенско спортско друштво Партизан из Београда.

Прву генерацију играча чинили су: Милош Вранчић, Бранко Јаковљевић, Јово Малешевић, Слободан Трнинић, Мирослав Вранчић, Ненад Трнинић, Небојша Поповић, Милош Сајић, Влатко Мисија, Владо Врањеш.. Прву званичну утакмицу ЛСК је одиграо на свом терену против Слоге из Ивањске у оквиру Среске лиге-Бања Лука, а резултат је био 4:4. Године 1968. ЛСК привремено престаје са радом. Разлог томе је тешка ситуација, али и недостатак играча – одлазак омладине на студије широм Југославије.

Препород (1974)

Сусрет спортских пријатеља Томислава Бате Давидовића и Бранка Бањца био је одлучујући да се крене у нову фудбалску авантуру. Да би се бубамара опет закотрљала у Лакташима допринос су дали Младен Срдић и Муниб Ганибеговић, а Ганибеговић је написао Први Статут и Правилник клуба. Обновитељска Скупштина одржана је 17. јуна 1974. године. Изабрано је Радно предсједништво клуба, којег су чинили: Мијо Самарџија, Душко Кнежевић, Србољуб Јефтић, Ђуро Малешевић и Бранко Бањац. Одлучено је да се Клуб преминује из ЛСК у Раднички фудбалски клуб Лакташи, који ће касније добити име Фудбалски клуб Лакташи.

Ера Душана Татића (1980-1985)

Лакташи су кренули из најнижег ранга. Временом су бивали организационо све бољи, играчки јачи, крчили су свој пут ка фудбалској афирмацији. Тај златни период клуба везан је за име легендарног тренера Душана Татића, који је био најзаслужнији за клупске успјехе. 

Један од ријетких тренера тада са лиценцом, био је разлог да много играча из региона дође у Лакташе.Са Татићем је дошло и до експанзије цијеле општине, а уз клуб стају и тадашњи гиганти ГП Врбас и ФСУ Чајавец. Захваљући Татићу Лакташи су догурали до 4. нивоа такмичења у Југославији – Регионалној лиги СР БиХ, која је била ранг испод Републичке лиге СР БиХ.

Фудбалски савез Републике Српске

Формирањем Фудбалског савеза Републике Српске, 5. септембра 1992. године, Лакташи су своје мјесто нашли у Другој лиги Републике Српске – група Бања Лука. Клуб је у овој лиги углавном освајао мјеста у средини табеле. Реорганизацијом Савеза 2000. године, Лакташи су се преселили у трећи ранг такмичења.

Ренесанса Владе Јагодића (2003-2008)

Најљепша фудбалска прича у Лакташима кренула је на иницијативу великог ентузијасте и предсједника клуба Миће Угреновића, који у зиму 2003. године за шефа стручног штаба именује Владу Јагодића. Врло брзо ће се испоставити да му је то био исправан потез, јер су Лакташи одмах на прољеће кроз бараж изборили пласман у Другу лигу Републике Српске – група Запад, а у мечу одлуке су били бољи од Омладинца из Брестовчине (5:1).

На друголигашком Западу изабраници Владе Јагодића боравили су само годину дана, јер су одмах изборили улазак у елиту Српске. У својој премијерној сезони у Првој лиги Републике Српске 2004/2005. Лакташи су завршили на 6. мјесту у конкуренцији 16 тимова, освојивши 48 бодова. Највећу побједу те сезоне остварили су против Херцеговца у Билећи (0:5), док су најтежи пораз претрпили у Зворнику од Дрине (4:0). Прволигашку сезону 2005/2006. Лакташани су окончали на позицији број 13, а у 30 утакмица освојили су 39 бодова. Најубједљивији тријумф забиљежен је на домаћем терену против Никос Канбере (6:1), а пораз од Љубића у Прњавору (4:0).

И коначно, сан је постао јава у сезони 2006/2007. Неколико година припремања и организационог јачања клуба уродиле су плодом, а тим предвођен капитеном Винком Мариновићем у јуну 2007. постао је шампион Републике Српске. Лакташи су уписали 17 побједа, 8 неријешених и 5 пораза, уз гол-разлику 45:21. Највећу побједу у шампионској сезони Лакташани су забиљежили на домаћем терену против Омладинца из Бања Луке (5:0), док су најтежи пораз доживјели у Војковићима од Фамоса (2:1). Капитен Винко Мариновић постигао је највише голова у тиму (9). Једини конкурент у борби за пласман у Премијер лигу БиХ био је Борац из Шамца, којег су Лакташи савладали у оба наврата (2:1; 0:3).

Премијерлигашка одисеја (2007-2010)

У склопу припрема за бх. елиту клуб је током љета 2007. ангажовао неколико појачања, међу којима су били Дарко Љубојевић, Златко Ђорић, Миљан Бајић, Марко Благојевић, Ненад Студен… Жријеб је одлучио да ватрено крштење Лакташа у Премијер лиги Босне и Херцеговине буде у Источном Сарајеву код Славије. Историјски деби одигран је 4. августа 2007. на стадиону у Лукавици, а окончан је резултатом 0:0. У посљедњим минутама сусрета голман Лакташа Синиша Мркобрада одбранио је пенал Дарку Спалевићу, чиме је клубу осигурао вриједан бод на премијери.
У својој првој утакмици на Градском стадиону у Лакташима, већ у наредном колу, екипа Владе Јагодића угостила је Травник и, у доста тешким условима, остварила прву побједу у бх. елити (3:1).
Дебитантску сезону Лакташи су завршили на 10. мјесту у конкуренцији 16 клубова. Статистика каже да су у 30 утакмица 13 пута тријумфовали, исто толико пута бивали поражени, док су 4 меча завршена без побједника. Најубједљивија побједа те сезоне остварена је кући против фаворите за титулу зеничког Челика (4:0), док је најболнији пораз претрпљен на Пироти од Травника (5:1).

У сезони 2008/2009. Лакташи су остварили и најбољи пласман, када су на полусезони заузимали 3. мјесто на табели. Падали су на Градском Жељезничар, Сарајево, Вележ, Леотар… а у Бања Луци је савладан и Борац резултатом 1:0. Ипак, крај сезоне дочекали су осмопласирана екипа са 42 бода, оставивши иза себе и Жељезничар. Побјеђивало се 12 пута, исто толико губило, а 6 утакмица завршено је неријешено. Највећи тријумф забиљежен је на домаћем терену против Леотара (4:0), а највећи пораз опет од Травника у гостима (5:2).

Сезона 2009/2010. била је посљедња у елитном јату. Осам освојених бодова у јесењем дијелу сезоне ипак је било премало да би се на крају изборио опстанак. У зимској паузи, у јануару 2010. године, клуб је као спортски дирецтор преузео Слободан Комљеновић, бивши репрезентативац Југославије. Недуго затим за њим стижу кондициони тренер из Њемачке Тхомас Геист и шеф стручног штаба, прослављени стручњак из Србије Драгослав Степановић. Одрађене су припреме у Анталији, ангажовано доста појачања и све је упућивало на то да би Лакташи могли опстати у друштву најбољих. У 15 утакмица тог прољећа реномирана екипа остварила је учинак од 8 побједа, 2 неријешена и 5 пораза. За опстанак у лиги фалио је 1 бод.

Прва лига Републике Српске (2010-2012)

Након испадања из Премијер лиге Босне и Херцеговине клуб је остао без Управе али и великог броја играча, па је такмичење у Првој лиги у августу 2010. започео са доста измијењеним саставом. Оба повратника, Лакташи и Модрича, словили су за фаворите, међутим само на папиру. Сезону 2010/11. Лакташи су окончали на 10. мјесту у конкуренцији 14 тимова, освојивши исти број бодова као и Модрича (35). Од прволигашког друштва Лакташи су се опростили у сезони 2011/12. као претпоследња екипа на табели, која је у 26 утакмица освојила 28 бодова. Одустајањем Црвене земље из Нове Веси од такмичења Лакташима је понуђено мјесто у Првој лиги Републике Српске упркос испадању, али Управа клуба није прихватила позив због тешке финансијске ситуације.

Дуга друголигашка деценија (2012-2022)

У овом периоду клуб је углавном освајао мјеста у средини табеле, а посебну драж такмичењу давали су општински дербији са Жупом из Милосаваца и Слогом из Трна. Ако су Душан Татић и Владо Јагодић обиљежили један дио клупске историје, онда је посљедња деценија протекла у знаку Миљана Бајића. Након три премијерлигашке сезоне с Лакташима (2007-2010), у тим се поново вратио из Козаре у другој половини сезоне 2012/2013. на позив директора Томислава Савића. Као играч, а потом и као тренер сврстао се у легенде Лакташа, чувајући клуб од понора и предводећи га до сјаја – пласмана у Прву лигу Републике Српске у прољеће 2022. године. Долазак новог руководства на челу са предсједником, а касније и градоначелником Лакташа Мирославом Бојићем у јуну 2021. био је полазна тачка у борби за повратак у елиту Српске, јер се клуб у наредном периоду организационо и финансијски стабилизовао а екипа адекватно појачала. Показала је то и табела, према којој Лакташима није било равних. Једини конкурент била је Слобода из Мркоњић Града, а побједа од 3:0 на гостовању у новембру 2021. била је прекретница у борби за титулу.